Kelebihan utama kacukan F1 bagi pertanian juga merupakan kelemahannya. Apabila kultivar F1 digunakan bagi bagi pembiakan generasi baru, keturunannya (generasi F2) juga banyak berbeza sesama sendiri. Sesetengah generasi F2 mungkin memiliki banyak gen homozygous, seperti dijumpai pada generasi keluarga lebih lemah, dan ini akan mengurangkan hasil tuaian dan kekurangan kesuburan kacukan. Dari sudut pandangan pengeluar biji benih komersial yang tidak mahu pelanggannya menghasilkan biji benihnya sendiri, kepelbagaian genetik ini merupakan ciri-ciri yang diingini.
Kedua-dua pembiakan dalam dan penyilangan memerlukan banyak kerja, yang diterjemah kepada kos biji benih yang lebih tinggi. Secara umum, hasil tuaian lebih tinggi melampaui kelemahan ini.
Kacukan F1 matang pada masa yang sama apabila dibesarkan pada keadaan persekitaran yang sama. Ini menarik minat petani moden kerana kesemua tanaman masak pada masa yang sama dan boleh dituai oleh mesin. Variati tradisi sering kali lebih berguna kepada pekebun kerana ia matang pada tempoh lebih lama, mengelakkan tempoh lempahan dan kekurangan makanan.
